2-2-2- اپیدمولوژی ویروس……………………………………………………………………………………………… 11

 

 

2-2-3- نشانه­های بیماری ویروس موزاییک هندوانه……………………………………………………………… 12

 

 

2-3- تمایز سرولوژیکی جدایه­های ویروس…………………………………………………………………………… 13

 

 

2-4- نوترکیبی و تنوع ژنتیکی ویروس­های گیاهی…………………………………………………………………. 14

 

 

2-5- تنوع ژنتیکی ویروس موزائیک هندوانه. 16

 

 

2-6- بررسی­های صورت گرفته در مورد ویروس موزاییک هندوانه در دنیا…………………………………… 17

 

 

2-6-1- ویروس موزاییک هندوانه درایران……………………………………………………………………………. 17

 

 

2-6-2- ویروس موزاییک هندوانه در خارج از کشور……………………………………………………………. 22

 

 

 

 

 

فصل سوم: مواد و روش­ها

 

 

3-1- زمان و مکان تحقیق………………………………………………………………………………………………….. 34

 

 

3-2- جمع آوری نمونه­ها و داد­ه………………………………………………………………………………………… 34

 

 

3-3- آزمون الایزا…………………………………………………………………………………………………………….. 35

 

 

 

 

 

فهرست مطالب

 

 

عنوان                                                                                                                صفحه

 

 

 

 

 

3-3-1- آزمون الیزای غیر مستقیم…………………………………………………………………………………………. 35

 

 

3-4- آزمون PCR. 36

 

 

3-4-1- استخراج RNA و ساخت cDNA.. 36

 

 

3-4-2- مرحله PCR. 37

 

 

3-4-2-1- آغازگرهای اختصاصی.. 38

 

 

3-5- روش تهیه­ی ژل و انجام الکتروفورز برای بررسی نتایج آزمون PCR…………………………………. 39

 

 

3-6- ترادف‌یابی محصول PCR. 40

 

 

3-7- تجزیه و تحلیل داده­ها 40

 

 

 

 

 

4-1- نتایج آزمون الایزا 42

 

 

4-2- نتایج آزمون RT-PCR. 43

 

 

4-3- تنوع ژنتیکی بین جدایه­های WMV……………………………………………………………………………… 46

 

 

4-4- نوترکیبی بین جدایه­هایWMV…………………………………………………………………………………… 47

 

 

4-5- مقایسه شباهت­ها و تفاوت­های ناحیه CP جدایه­های WMV در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی 52

 

 

6- موتیف­های موجود در جدایه WMV ………………………………………………………………………………. 55

 

 

 

 

 

فصل پنجم:

 

 

بحث……………………………………………………………………………………………………………………………….. 57

 

 

 

پیشنهادات اجرایی و پژوهشی…………………………………………………………………………………………………. 62

 

 

 

 

 

منابع………………………………………………………………………………………………………………………………… 63

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست جدول‌ها

 

 

عنوان                                                                                                                 صفحه

 

 

جدول 1-1- برآورد سطح، تولید و عملکرد در هکتار محصولات زراعی استان گلستان…………………… 4

 

 

جدول 3-1- تعداد نمونه و مزارع نمونه برداری شده در استان گلستان……………………………………….. 35

 

 

جدول 3-2- مواد لازم در واکنش PCR………………………………………………………………………………… 38

 

 

جدول 3-3- شرایط و سیکل‌های حرارتی برنامه ریزی شده برای انجام PCR ……………………………… 38

 

 

جدول 3-4- دو جفت آغازگر اختصاصی WMV از ناحیه CP-UTR ………………………………………… 39

 

 

جدول 4-1- تنوع ژنتیکی و نسبت جانشینی آمینواسیدی در جدایه­های مختلف WMV در جمعیت­ها و گروه‌های فیلوژنتیک   47

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست شكل‌ها

 

 

عنوان                                                                                                                 صفحه

 

 

 

 

 

شکل 4-1- علایم بیماری ویروسی WMV روی برگ و میوه هندوانه…………………………………………. 42

 

 

شکل 4-2- نتایج آزمون PCR در ژل آگارز………………………………………………………………………….. 43

 

 

شکل 4-3- درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده به روش neighbor joinig………………………………………. 45