1- 1- 2- 1-  سیستماتیک……………………………………………………………………………………………… 5

 

 

1- 1- 2- 2-  ویژگی‌های مریستیک ……………………………………………………………………………… 6

 

 

1- 1- 2- 3-  رنگ……………………………………………………………………………………………………………. 6

 

 

1- 1- 2- 4-  زیستگاه……………………………………………………………………………………………………… 6

 

 

1- 2- معرفی حوضه‌ی آبی مورد مطالعه…………………………………………………………………………………….. 7

 

 

1- 2- 1-  دریاچه‌ی مهارلو…………………………………………………………………………………………………….. 7

 

 

1- 2- 2-  وضعیت حوضه‌ی آب ریز دریاچه‌ی مهارلو…………………………………………………………. 9

 

 

1- 2- 3-  چشمه های منتهی به دریاچه‌ی مهارلو………………………………………………………………. 10

 

 

1- 2- 4-  تشکیلات زمین شناسی……………………………………………………………………………………….. 11

 

 

1- 2- 5-  آب و هوا……………………………………………………………………………………………………………….. 11

 

 

1- 3-  مطالعات مولکولی……………………………………………………………………………………………………………… 11

 

 

1- 3- 1-  مطالعات تنوع ژنتیکی در ماهیان………………………………………………………………………… 12

 

 

1- 3- 2-  تکنیک‌های مولکولی…………………………………………………………………………………………….. 12

 

 

1- 3- 2- 1-  تکنیک‌های DNA……………………………………………………………………………………. 12

 

 

1- 3- 2- 1- 1-  تكنیك PCR………………………………………………………………………………………. 12

 

 

1- 4-  ژنوم هسته………………………………………………………………………………………………………………………… 13

 

 

1- 4- 1-  DNAتکراری…………………………………………………………………………………………………………. 13

 

 

1- 4- 1- 1-  VNTR ((Variable Number Tandem Repeat………………………………….. 14

 

 

1- 4- 1- 2- ریز ماهواره (Microsatellite) …………………………………………………………………… 15

 

 

1- 5- تعیین ساختار ژنتیکی جمعیت ………………………………………………………………………………………. 16

 

 

1- 5- 1-  مدل هاردی-  واینبرگ و دلیل انحراف از آن…………………………………………………….. 16

 

 

عنوان                                                                                                صفحه

 

 

 

 

 

1- 5- 2-  F- Statistics………………………………………………………………………………………………………… 18

 

 

1- 5- 3-  شباهت و فاصله‌ی ژنتیکی…………………………………………………………………………………… 19

 

 

1- 6-  هدف از انجام پژوهش………………………………………………………………………………………………………. 20

 

 

 

 

 

فصل دوم : مروری برمطالعات گذشته

 

 

2- 1-  مطالعات انجام شده روی جنس Aphanius…………………………………………………………………… 22

 

 

2- 2-  مطالعات انجام شده در مورد گونه Aphanius farsicus در ایران…………………………………. 24

 

 

 

 

 

فصل سوم: مواد و روش ها

 

 

3- 1-  نمونه برداری……………………………………………………………………………………………………………………… 26

 

 

3- 2-  مطالعات مولكولی……………………………………………………………………………………………………………… 28

 

 

3- 2- 1-  استخراج DNA …………………………………………………………………………………………………… 28

پایان نامه و مقاله

 

 

 

3- 2- 1- 1-  ارزیابی کیفیت و کمیت DNA استخراج شده………………………………………. 29

 

 

3- 2- 2-  انتخاب آغازگر……………………………………………………………………………………………………….. 30

 

 

3- 2- 3-  انجام واکنش زنجیره‌یی پلیمراز (PCR)……………………………………………………………… 31

 

 

3- 2- 4-  الکتروفورز محصول PCR…………………………………………………………………………………….. 34

 

 

3- 2- 4- 1-  تهیه‌ی آکریل آمید 30 درصد…………………………………………………………………. 34

 

 

3- 2- 4- 2-  تهیه‌ی X)10TBE((Tris, Boric Acid,EDTA)…………………………………… 34

 

 

3- 2- 4- 3-  آمونیوم پر سولفات 10٪(A.P.S) (Amonium per sulfate)……………….. 34

 

 

3- 2- 4- 4-  TEMED…………………………………………………………………………………………………… 35

 

 

3- 2- 4- 5-  تهیه ژل پلی آکریل آمید 7٪………………………………………………………………….. 35

 

 

3- 2- 4- 5- 1-  تجهیزات مورد استفاده……………………………………………………………………….. 35

 

 

3- 2- 4- 5- 2-  روش کار……………………………………………………………………………………………… 35

 

 

3- 2- 5-  رنگ آمیزی ژل پلی آکریل آمید با نیترات نقره…………………………………………………. 36

 

 

3- 2- 5- 1-  مواد مورد استفاده……………………………………………………………………………………… 36

 

 

3- 2- 5- 2-  تجهیزات مورد استفاده……………………………………………………………………………… 36

 

 

3- 2- 5- 3-  روش کار……………………………………………………………………………………………………. 36

 

 

3- 2- 6-  ثبت تصاویر……………………………………………………………………………………………………………. 36

 

 

3- 2- 7-  آنالیز آماری……………………………………………………………………………………………………………. 37

 

 

عنوان                                                                                                صفحه

 

 

 

 

 

فصل چهارم: نتایج

 

 

4- 1-  نتیجه‌ی بررسی كیفیت و كمیت DNA استخراجی…………………………………………………….. 39

 

 

4- 2-  نتایج PCR………………………………………………………………………………………………………………………… 39

 

 

4- 3-  تعداد و طول آلل‌ها…………………………………………………………………………………………………………… 41

 

 

4- 4-  فراوانی آلل‌ها…………………………………………………………………………………………………………………….. 41

 

 

4- 5-  تعداد آالل واقعی (Na) و موثر (Ne)………………………………………………………………………………… 42

 

 

4- 6-  تنوع ژنتیكی……………………………………………………………………………………………………………………… 43

 

 

4- 7-  تعادل هاردی-  واینبرگ………………………………………………………………………………………………….. 45

 

 

4- 8-  آنالیز آماری AMOVA……………………………………………………………………………………………………. 46

 

 

4- 9 جریان ژنی (ضریب مهاجرت)……………………………………………………………………………………………… 48

 

 

4- 10-  شباهت و فاصله ژنتیكی………………………………………………………………………………………………… 49

 

 

 

 

 

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری

 

 

5- 1-  تنوع ژنتیکی……………………………………………………………………………………………………………………… 52

 

 

5- 2-  تعادل هاردی-  واینبرگ………………………………………………………………………………………………….. 54

 

 

5- 3-  تمایز ژنتیکی…………………………………………………………………………………………………………………….. 55

 

 

5- 4-  جریان ژنی ( مهاجرت)…………………………………………………………………………………………………….. 57

 

 

5- 5-  نتیجه گیری نهایی……………………………………………………………………………………………………………. 59

 

 

5- 6- پیشنهادها……………………………………………………………………………………………………………………………. 60

 

 

5- 7-  توصیه ها…………………………………………………………………………………………………………………………… 60

 

 

 

 

 

فهرست منابع و مآخذ

 

 

منابع فارسی ………………………………………………………………………………………………………………………………….. 61

 

 

منابع انگلیسی…………………………………………………………………………………………………………………………………. 63

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست جدول ها

 

 

عنوان                                                                                                 صفحه

 

 

جدول 3- 1 منطقه‌های نمونه برداری و تعداد ماهی گورخری فارسی مورد مطالعه در این پژوهش    29

 

 

جدول3- 2 خصوصیات جایگاه‌های ژنی (آغازگر) مورد استفاده در این پژوهش……………………… 31

 

 

جدول3- 3 نوع و مقدار مواد مورد استفاده برای PCR در این پژوهش…………………………………… 31

 

 

جدول3- 4 برنامه چرخه حرارتی PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های ماهی

 

 

گورخری فارسی با استفاده از آغازگرAf7…………………………………………………………………………………….. 32

 

 

جدول3- 5 برنامه چرخه حرارتی PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی  جمعیت‌های ماهی

 

 

گورخری فارسی با استفاده از پرایمر Af20……………………………………………………………………………….. 32

 

 

جدول 3- 6 برنامه چرخه حرارتی PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی  جمعیت‌های ماهی

 

 

گورخری فارسی با استفاده از پرایمر Af20b………………………………………………………………………………. 32

 

 

جدول3- 7 برنامه چرخه حرارتی PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی  جمعیت‌های ماهی

 

 

گورخری فارسی با استفاده از پرایمر Af61……………………………………………………………………………….. 33

 

 

جدول3- 8 برنامه چرخه حرارتی PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی  جمعیت‌های ماهی

 

 

گورخری فارسی با استفاده از پرایمرAf18…………………………………………………………………………………. 33

 

 

جدول4- 1 شرایط  PCRدر جایگاه‌های ژنی مورد مطالعه در ماهی گورخری

 

 

فارسی…………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 40

 

 

جدول 4- 2 تعداد و طول آلل‌های به‌دست آمده (بر حسب bp) در پنج جایگاه ژنی مورد

 

 

مطالعه در ماهی گورخری فارسی…………………………………………………………………………………………………. 41

 

 

جدول 4- 3 فراوانی آللی در پنج جایگاه ژنی مورد مطالعه درماهی گورخری فارسی…………….. 42

 

 

جدول4- 4 تعداد آلل واقعی (Na) و موثر (Ne) در پنج جایگاه ژنی برای هر جمعیت ماهی

 

 

گورخری فارسی در منطقه‌های مورد مطالعه……………………………………………………………………………… 43

 

 

جدول4- 5  میانگین تعداد آلل واقعی (Na) و موثر (Ne) برای هر جمعیت ماهی

 

 

گورخری فارسی در منطقه‌های مورد مطالعه……………………………………………………………………………….. 43

 

 

جدول 4- 6 مقادیر هتروزیگوسیتی مشاهده شده (Ho) و مورد انتظار (He) برای هرجمعیت از ماهی گورخری فارسی در منطقه‌های مورد مطالعه درهر جایگاه ژنی………………………………………………………………………………………………………. 44

 

 

 

 

 

عنوان                                                                                                 صفحه

 

 

جدول 4- 7 مقادیرهتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار در سطح پنج   جایگاه ژنی در كل نمونه‌های ماهی گورخری فارسی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 44

 

 

جدول4- 8 میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده (Ho) و مورد انتظار ((He برای هر جمعیت ماهی گورخری فارسی در منطقه‌های مورد مطالعه…………………………………………………………………………………………………………………………………….. 44

 

 

جدول 4-  9 بررسی تعادل هاردی-  واینبرگ در پنج جایگاه ژنی برای هر جمعیت ماهی  گورخری فارسی در منطقه‌های مورد مطالعه ……………………………………………………………………………………………………………………………………………. 45

 

 

جدول 4- 10 میزان FST محاسبه شده بر اساس آزمون  AMOVAبین جمعیت‌های ماهی گورخری فارسی در مناطق مورد مطالعه …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 46

 

 

جدول4- 11 آنالیز واریانس مولكولی (AMOVA) ماهی گورخری فارسی. Df (درجه آزادی)،  SS(مجموع مربعات)،Ms  (انحرافات میانگین مربع)، Prob …………………………………………………………………………………………………………………….. 47

 

 

جدول 4- 12 میزان  RSTمحاسبه شده بر اساس آنالیز AMOVA بین جمعیت‌های ماهی گورخری فارسی در مناطق مورد مطالعه …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 47

 

 

جدول4- 13 آنالیز واریانس مولكولی (AMOVA) در ماهی گورخری فارسی. Df (درجه آزادی)، SS (مجموع مربعات)، Ms (انحرافات میانگین مربع)، Prob …………………………………………………………………………………………………… 48

 

 

جدول 4- 14 میزان جریان ژنی محاسبه شده بین جمعیت‌های مناطق مورد مطالعه در ماهی گورخری فارسی بر اساس آنالیز AMOVA………………………………………………………………………………………………………………………………………. 49

 

 

جدول 4- 15 ماتریس فاصله ژنتیكی (اعدادزیر قطر) و شباهت ژنتیكی (اعداد بالای قطر) بین جمعیت‌های مناطق مورد مطالعه در ماهی گورخری فارسی……………………………………………………………………………………………………………………. 49

 

 

 

 

 

فهرست شکل ها

 

 

عنوان                                                                                                 صفحه

 

 

 

 

 

شکل1- 1-  الف: نر، ب: ماده و ج: زیستگاه طبیعی A. farsicus……………………………………………… 6

 

 

شکل1- 2-   عكس هوایی از دریاچه‌ی مهارلو و موقعیت آن نسبت به شهر شیراز……………….. 8

 

 

شكل1- 3-  عكس هوایی از دریاچه‌ی مهارلو و موقعیت آن نسبت به کوه‌های اطراف………….. 8

 

 

شكل 1- 4-   نقشه‌ی حوضه‌های آبریز استان فارس و موقعیت حوضه‌ی مهارلو و دریاچه آن در پهنه‌ی استان 10

 

 

شكل3- 1-  عكس هوایی از دریاچه‌ی مهارلو و موقعیت برخی از چشمه های مورد مطالعه در این پژوهش (نقاط قرمز رنگ) نسبت به آن……………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 27

 

 

شكل3- 2-  عكس هوایی از حاشیه‌ی شمال غربی دریاچه‌ی مهارلو و آب‌های ورودی به آن 27

 

 

شکل 4- 1 نتایج  حاصل از FST به‌دست آمده از آزمون AMOVA در ماهی

 

 

گورخری فارسی……………………………………………………………………………………………………………………………… 47

 

 

شکل4- 2 نتایج حاصل از  RSTبه‌دست آمده از  AMOVAدرماهی

 

 

موضوعات: بدون موضوع  لینک ثابت


فرم در حال بارگذاری ...